1973 gründete Eberhard Junkersdorf mit Volker Schlöndorff und Reinhard Hauff die Bioskop Film. Die Bioskop Film hat seitdem ca. 50 Spielfilme produziert. Junkersdorf ist u.a. Vorstandssprecher der Arbeitsgemeinschaft Neuer Deutscher Spielfilmproduzenten sowie Vorsitzender des Verwaltungsrates und Präsident der F.F.A. Berlin. 1995 gründete Eberhard Junkersdorf das Zeichentrick-Studio Munich Animation. Die erste Produktion des Studios war der abendfüllende Animationsfilm "Die Furchtlosen Vier", für den Junkersdorf mit dem Bayerischen Produzentenpreis ausgezeichnet wurde. Für diesen Film führte Eberhard Junkersdorf erstmals auch Regie.